Анализ соматических мутаций при онкологических заболеваниях с использованием биочипов

Т.В. Наседкина, М.А.Емельянова, Ю.Е. Яценко, Ф.А. Амосенко, Л.Н. Любченко

ИМБ им. В.А. Энгельгардта РАН, Москва

Медико-генетический научный центр РАМН, Москва

РОНЦ им. Н.Н.Блохина РАМН, Москва

Соматические мутации в опухолевых клетках могут служить диагностическими и прогностическими маркерами, а также определять чувствительность к противораковым препаратам.

Детекция соматических мутаций в K-Ras в клетках ряда сoлидных опухолей имеет важное прогностическое значение при назначении противоопухолевой терапии. Знание статуса гена K-Ras у конкретного пациента позволяет подобрать индивидуальное лечение, увеличивая его эффективность и уменьшая риск развития токсических реакций.

Разработан биочип, позволяющий определять наиболее часто встречающиеся мутации в 12- 13 и 61 кодонах гена K-Ras . Сложность детекции соматических мутаций в биоптате опухоли заключается в резком количественном преобладании последовательностей дикого типа над мутантными.

Для подавления амплификации последовательностей дикого типа в реакционную смесь вводили специфические LNA-олигонуклеотиды. Продукты амплификации гибридизовали с олигонуклеотидными зондами, иммобилизованными на поверхности биочипа. Исследовали клинические образцы ДНК пациентов с опухолями поджелудочной железы. Мутации были обнаружены в 35 (77%) образцах из 46. Метод позволяет определять мутации при наличии 4% опухолевых клеток в образце.

Также разработаны биочипы для определения мутаций в генах NPM1 и FLT3 при гемобластозах. Исследованы 140 образцов ДНК детей, больных острым нелимфобластным лейкозом. Мутации в гене NPM1 были обнаружены у 7 (5%) из 140 пациентов.

Разработанные биочипы позволяют быстро и с высокой достоверностью определять соматические мутации в опухолевых клетках и могут быть использованы в рутинной клинической диагностике.

Работа поддержана Российским фондом фундаментальных исследований (проект № 08-04-01480).<< ПредыдушаяСледующая >>
Внимание, только СЕГОДНЯ!